一天内,连发3篇Science并登上封面!这所西部双一流高校太牛了!

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来源 | 西北工业大学新闻网、募格学术

作者 | 王鹏、知识分子、西北工业大学官网等

6月21日,西北工业大学生态与环境保护研究中心(下文简称“生态中心”)以西北工业大学为通讯作者单位在Science杂志同一期发表三篇研究长文(Research article),并以“反刍动物基因组”为专栏,登上了当期封面。

这一研究在国际上首次对反刍动物基因组进行了系统分析研究,揭示了反刍动物部分重要特性的基因密码。

其中,西北工业大学为两篇论文的第一完成单位、另一篇论文是第一通讯作者单位。值得注意的是,在这些成果的产出中,生态与环境保护研究中心所培养的研究生发挥了重要作用。这些成果不仅标志着该校在生态与环境保护领域基础研究取得了重大进展,更标志着该校在研究生创新人才培养方面取得了突出的成果。

论文介绍

 

01

三篇论文中的旗舰论文Large-scale ruminant genome sequencing provides insights into their evolution and distinct traits,基于大数据分析计算和基因组测序等技术,对44个反刍动物的基因组进行了测序、组装和全基因比较分析,覆盖了反刍亚目的全部6个科和一半以上的属,厘清了关于反刍动物系统发育进化的长久争议,并构建了目前可信度最高的反刍动物物种进化树。
 
同时,研究通过深入探讨反刍动物的适应演化机制,反映了反刍动物对复杂环境、食物的适应能力,并为未来反刍动物乃至哺乳动物和人类健康的研究提供了珍贵的数据和参考。

生态中心2019级博士生林泽山为该文章的共同第一作者,博士生刘贵春、刘畅、羊洁、张晨州、殷源、张如、万雯婷,硕士生张晨、王忠凯、覃艳丽等人共同参与了该论文的部分工作。

02

研究长文Biological adaptations in the Arctic cervid, the reindeer (Rangifer tarandus),通过比较基因组学和进化基因组分析以及实验验证手段,发现驯鹿维生素D代谢通路中的两个关键基因受到了强烈的自然选择,其编码的酶活性比其它动物大幅提升,这可能使得驯鹿对钙离子的吸收能力大大增强。同时,驯鹿的节律通路中的核心调控基因发生了特异性突变,实验证明该突变导致其与另一个节律核心基因无法结合,驯鹿因此昼夜节律影响,从而能适应北极极昼和极夜的光照环境。该研究的结果使人们对极地动物的适应有了更为全面和深入的了解,同时也对一些人类健康问题提供了的重要线索,如维生素D对钙沉积的影响,以及生物钟的调控对治疗人类睡眠障碍的提示。该研究也为后续开展驯鹿的保护提供了重要数据基础。

该文第一作者是生态中心博士生林泽山,在文章撰写和基因组数据分析等方面做了大量工作。林泽山于2012-2016年在华中科技大学完成本科阶段学习;2016年至今,在西工大师从王文教授攻读硕士及博士学位,硕士期间就以共同第一作者的身份在GigaScience上发表了驯鹿的基因组解析文章。
 
此外,生态中心博士生杨月、夏文豪等为该文共同第一作者,完成了实验验证工作;博士生刘畅参与了基因组分析。中国农科院特产研究所的李志鹏副研究员,西工大王文教授、邱强教授为该论文的共同通讯作者。
 

03

研究长文Genetic basis of ruminant headgear and rapid antler regeneration对数十种反刍动物进行了多组学大数据分析,首次系统地揭示了角的发育演化的遗传基础,解析了鹿角的再生分子机制及其与抗癌性相关性的基因基础。已鉴定的基因及其特定突变为未来角的发育,哺乳动物器官再生和肿瘤发生的功能研究开拓了新方向。

生态中心硕士生张晨州等人为该文的共同第一作者。张晨州本科就读于四川农业大学。2016年保送西工大生态中心攻读硕士学位,师从王文教授;硕士期间以第一作身份在GigaScience(IF: 7.2, 2017)上发表了麋鹿基因组解析文章;现已被西工大录取为2019级秋季博士,将继续在王文教授的指导下攻读博士学位。此外,博士生刘畅也参与了该论文的部分分析工作。西工大邱强教授、王文教授,西北农林科技大学姜雨教授为该文共同通讯作者。
 

论文详情:
https://science.sciencemag.org/content/364/6446/eaav6202 
https://science.sciencemag.org/content/364/6446/eaav6312 
https://science.sciencemag.org/content/364/6446/eaav6335

王文团队,十年磨一剑

 

一天之内在Science连发三篇研究论文,我们不能忽视“王文”这个名字。

西北工业大学教授王文 图源:知识分子
 
据知识分子报道,十年前,王文和同事启动山羊、绵羊基因组项目时就在酝酿研究反刍动物。
 
王文教授说:“反刍动物无论科学和应用上都有重要意义,但遗憾的是,这么一群如此重要的哺乳动物,甚至连科级水平的分类都存在争议,它们各种独特性状的遗传基础也多半是谜。”
 
所幸的是,西北工业大学与国际上20多个机构一起,完成了反刍动物基因组计划项目,并发表了这三篇研究长文,以阐明反刍动物一系列重要的科学问题。此次文章的发表,也可谓是“十年磨一剑”。
 
而根据官网对王文教授的简介,也不得不让小募佩服一句“厉害”。
 
王文是博士生导师,西北工业大学生态与环境保护研究中心二级教授。国家杰出青年基金获得者、“新世纪百千万人才工程国家级入选者”、科技部中青年领军人才,中国遗传学会常务理事、动物遗传专业委员会主任、《中国科学.生命科学》编委、中国科学院昆明动物研究所“遗传资源与进化国家重点实验室”学术委员会委员,中科院动物进化与遗传前沿交叉卓越创新中心首席科学家之一。
 
2007年和2012年作为首席科学家分别获得“973”项目的支持,2008年获得中科院王宽诚西部学者杰出贡献奖和“谈家桢生命科学创新奖”,2010年获“云南省自然科学一等奖”(第一完成人),2012年获得“国家自然科学二等奖”(第一完成人)。

长期从事进化遗传学和进化基因组学研究,在新基因及其功能起源机制,以及生物基因组进化和生物大数据分析挖掘方面取得了一批受到国际同行关注的成果,目前已经在Science、Nature Genetics、Nature Biotechnology、NatureCommunications、Nature、Nature Review Genetics、PNAS、Genome Research、Plant Cell 、PLoS Genetics、Trends in Genetics、Genome Biology、Molecular Biology and Evolution、Genetics等重要学术杂志上发表多篇论文。

H-index=36,发表的研究论文已被引用近8000次。培养了一批优秀博士生,包括华大基因集团首任轮值总裁(杨爽)、华大基因研究院院长(徐迅)、哥本哈根大学正教授(张国捷)、洛克菲勒大学tenure track助理教授(赵莉)、4名青年千人计划获得者、1名中科院百人计划、1名澳门大学助理教授,1名云南最年轻的博士导师等。(真的是大牛导师啊)
 

默默发力,这所高校有点牛

 
说完团队,接下来就要说说这所“低调”的双一流高校——西北工业大学

西北工业大学简称西工大,学校位于陕西西安,虽然西工大在校名称上未带“航空”“航天”“航海”之类的字样,但却是我国唯一一所以同时发展“三航”人才培养和科学研究的大学。其隶属于工业和信息化部。

新中国成立以来,西工大一直是国家重点建设的高校,1960年被国务院确定为全国重点大学,“七五”、“八五”均被国务院列为重点建设的全国15所大学之一,是全国首批设立研究生院的22所高校之一,1995年首批进入“211工程”,2001年进入“985工程”,2017年进入国家“一流大学”建设高校(A类),是“卓越大学联盟”成员高校。
 
截至2018年1月,学校的材料科学、工程学、化学、计算机科学等4个学科群进入ESI国际学科排名前1%,形成了以三航学科群为引领,3M(材料、机电、力学)学科群、3C(计算机、通信、控制)学科群。
 
学校有国家一级重点学科2个,分别是材料科学与工程、航空宇航科学与技术。
 

 
国家二级重点学科7个,分别是机械电子工程、固体力学、电路与系统、控制理论与控制工程、计算机应用技术、武器系统与运用工程、水声工程。

而此次,连发三篇文章的生态与环境保护研究中心,是学校在2015年成立的,其2016年开始招收研究生。

目前,生态中心已招收博士生21人,硕士生39人(其中在校硕士生26人,已毕业硕士5人,硕转博学生8人)。

自成立以来,生态中心以人类的可持续发展研究为使命,以培养具有国际视野的生态环境领域的科研杰出人才和领袖式精英人才为目标,秉承“以学生为根,以育人为本”的教育理念,以人才培养为核心、科学研究为支撑、服务社会为宗旨,教学和科研双轮驱动、互相促进。

生态中心现有5名博士生导师,分别为王瑞武教授,国家杰出青年基金获得者、中科院百人计划获得者;王文教授,国家杰出青年基金获得者、国家基金委创新研究群体首席科学家、2012年国家自然科学二等奖第一完成人;邱强教授,国家万人计划青年拔尖人才、国家优秀青年科学基金获得者;此外还有两位国家级青年人才王宇恒教授蔡晶教授
 
几位导师以其丰富的学识、严谨的治学态度、对学科前沿高度的战略把握和敏锐性、以及人格魅力感召学生,引导学生迅速把握学科背景,关注学科前沿热点,鼓励学生潜心钻研重大科学难题,着重培养学生的创新思维方式、突出的实践能力,以及独立提出科学问题、解决科学问题的能力。

从2015年年底至2018年,西工大生态与环境保护研究中心引进2个杰青、2个优青、1个副教授、4个助理教授、15个博士后、1个博士后创新计划获得者……短短两年多的时间,发展迅速壮大。

虽然过程极尽艰辛,但成果终不负众望。除上文所提到的研究生以外,生态中心还有很多优秀学生,如王瑞武教授团队的2016级博士生张小伟,以第一作者身份在生态学领域知名期刊Ecology上发表论文;王文教授团队的硕士生卓炳照,2018年曾作为Advisor代表学校参加2018年国际遗传工程机器设计竞赛(iGEM),获大赛银奖。

在西工大生态与环境保护研究中心里,从不忽视、淡漠年轻科研人员的个人价值。

研究方向负责人会瞄准学科前沿方向,提出好的科学问题,给年轻的科研人员经费支持,组织他们协同攻关或者独立钻研;科研人员在自己最擅长的领域,做自己最喜欢的方向。双方是互相信任的。中心和研究方向负责人信任科研人员,相信他们的努力和付出,所以会给予科研人员充分的自由;科研人员信任中心和研究方向负责人,相信这里的机制会帮助自己实现科研理想,所以会潜心做科研,不会为一城一池的得失而浮躁。

这片科研土地,就是西工大培育人才的土壤。

西北工业大学研究生院一直坚持多元化、创新型、国际化的研究生精英教育理念,全面实施研究生教育“六大提升计划”,高度重视研究生在科研工作中的自主创新和原始创新。
 
通过研究生种子基金、博士论文创新基金、短期出国(境)访学交流项目、研究生交叉学科创新团队建设项目等,激励研究生科研创新工作和学术交流合作,探索交叉创新人才培养模式。2018年,生态中心王瑞武教授带领的“自组织行为机制研究团队”获批研究生交叉学科创新人才培养团队。

五年来,该校研究生科研创新能力显著提升,共发表高水平论文19007篇,其中SCI检索6606篇,获授权国家发明专利2198项,获省优博71篇,学会优博9篇。研究生教育成果显著,获高等教育国家级教学成果奖一等奖1项、陕西省高等教育教学成果奖特等奖1项、中国学位与研究生教育学会研究生教育成果奖一等奖2项(一等奖全国仅9项)。

低调中却又稳步前进,我们也期待西工大带给我们更多的惊喜。

本文来源:募格学术 综合自西北工业大学新闻网  作者:王鹏、知识分子、西北工业大学官网等 转载本文请联系原作者获取授权,同时请注明本文来源。

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